Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms