Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms