Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms