Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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