Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt82Q99M74 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms