Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms