Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Dok4Q99KE3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dok4Q99KE3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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