Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ddb2Q99J79 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ddb2Q99J79 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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