Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms