Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms