Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms