Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde6cQ91ZQ1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Pde6cQ91ZQ1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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