Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms