Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cacng8Q8VHW2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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