Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PpcsQ8VDG5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PpcsQ8VDG5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PpcsQ8VDG5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms