Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms