Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cdk8Q8R3L8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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