Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OptnQ8K3K8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms