Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms