Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Mtmr3Q8K296 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Mtmr3Q8K296 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Mtmr3Q8K296 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Mtmr3Q8K296 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr3Q8K296 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms