Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms