Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Cldn34c1Q8K193 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c1Q8K193 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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