Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim32Q8CH72 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim32Q8CH72 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim32Q8CH72 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim32Q8CH72 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim32Q8CH72 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms