Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup88Q8CEC0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms