Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufl1Q8CCJ3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufl1Q8CCJ3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms