Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nhlrc3Q8CCH2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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