Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp44Q8C2S0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp44Q8C2S0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp44Q8C2S0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp44Q8C2S0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp44Q8C2S0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp44Q8C2S0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms