Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms