Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Znf428Q8C1M2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms