Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms