Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms