Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjd4Q8BSD4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms