Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htatsf1Q8BGC0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms