Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cpped1Q8BFS6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cpped1Q8BFS6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cpped1Q8BFS6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cpped1Q8BFS6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cpped1Q8BFS6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cpped1Q8BFS6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cpped1Q8BFS6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cpped1Q8BFS6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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