Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amigo1Q80ZD8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Amigo1Q80ZD8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amigo1Q80ZD8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amigo1Q80ZD8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms