Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms