Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SnupnQ80W37 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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