Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms