Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms