Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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