Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms