Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubfd1Q78JW9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubfd1Q78JW9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubfd1Q78JW9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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