Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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