Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms