Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmeff1Q6PFE7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmeff1Q6PFE7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmeff1Q6PFE7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmeff1Q6PFE7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmeff1Q6PFE7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmeff1Q6PFE7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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