Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc2Q6PDG5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcc2Q6PDG5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms