Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms