Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Zbtb40Q6PCS8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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