Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms