Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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